Alors oui c'est complètement vrai, Clamav n'est pas un antivirus à proprement parlé. Il s'agit plutôt d'un détecteur de virus (et autres malwares, ce qu'il fait très bien au passage ;) ).
Alors oui, nettoyer les fichiers inféctés, c'est pratique mais est ce que ça rend vraiment service ?
Pour l'utilisateur lambda, la réponse est toujours oui :) .
Mais finallement, si on prend du recul, c'est quoi le plus important ?

  • être infécté 1 fois par mois et prendre le risque de perdre des données ?
  • faire en sorte de ne pas être infécté ?

Je vote pour la deuxième proposition... En fait j'ai jamais eu de virus sur mon PC sous windows, et ceci pour 2 raisons je pense :

  • je suis derrière un routeur donc exit toutes les vulnérabilités réseaux de Windows
  • je filtre TOUS mes mails grace au trio postfix / amavisd-new / clamav.

Si par malheur, je suis infecté par un virus (si je vais sur un site louche par exemple ;) ), pour moi il n'y a qu'une solution : formatage.
Je pourrais très bien utiliser un Antivirus gratuit, mais je n'ai pas confiance. L'exemple de Nero est très parlant : celui ci détécte qu'il a été infécté en faisant une checksum sur son binaire. Seulement voilà, même après avoir désinfecté le binaire, Nero indique toujours qu'il a été modifié.
Comment ça s'interprete ?
Tout simplement l'antivirus n'a pas complètement nettoyé le fichier, il reste forcément des traces dans le binaire ce qui peut engendrer :

  • des plantages inexpliqués
  • des nouvelles infections
  • des fichiers corrompus (et donc inutilisables)

Donc non, un antivirus ne sert à rien une fois que l'infection est faite...