En mettant à jour ma debian testing (etch), j'ai vu qu'on était passé de apache2 à apache2.2. Le processus de migration du paquet et de ses dépendances s'est bien passé, mais lors de la relance du serveur, j'ai eu le droit à un joli message d'erreur :
Invalid command 'AuthUserFile', perhaps misspelled or defined by a module not included in the server configuration
Pourtant, AuthUserFile est bien écrit et je ne pense pas que ce nom ait subitement changé dans la configuration d'Apache!
En cherchant bien sur internet, je suis tombé sur la solution, il suffit de taper :

a2enmod authn_file
Le problème vient tout simplement d'un module qui a changé de nom, non pris en charge dans le processus de migration.
ça donne quand même des sueurs froides cette histoire...